位於神奈川縣橫濱的總持寺，始創於公元1312年，與越前永平寺齊名，兩寺曾互爭總本山地位，至元和元年（1616年），認定兩寺同為日本曹洞宗大本山（總持寺為能本山，永平寺為越本山，並稱兩大本山）。

占地廣大、新舊混合的現代式禪寺
1898年，總持寺不幸遭回祿之災，舊有建築悉成灰燼；1907年將寺基從石川縣遷移到如今的寺址、重新建造；1923年又遇關東大地震，再度重創寺廟建築，之後經過重建，因此現在看到的總持寺不像是有七百餘年歷史的古寺，而是占地廣大、建築新穎的現代式禪寺，寺內除了有鶴見大學，並經營三松學林、光華女學校、鶴見高等女學校（從幼兒園到大學）等教育單位作育英才，並開設鶴見社會館、鶴見公益質屋等社會事業。

重建後的總持寺仍有著傳統「七堂伽藍」，寺院正門（三門）是七堂伽藍的第一堂，為鋼筋混凝土結構，其威嚴雄偉堪稱日本第一，高大的門樓上懸掛着「諸嶽山」匾額；大祖堂內供奉高祖道元、太祖瑩山、二祖峨山等諸位祖師，樓高36公尺（約十層樓高），擁有千張榻榻米大小（約500坪）的大廳，相當宏偉壯觀。

在總持寺前方可俯瞰東京灣和房總半島美景，吸引許多遊客前來參訪，這座「曹洞宗大本山」，今天儼然已成為一所世界知名的國際化禪宗道場，任何人都可以來此參觀、參拜，並體驗坐禪。

總持寺面積達五十萬平方公尺，除了有佛殿、大祖堂等衆多堂宇及教育機構外，還有敕使門、傳道館、大僧堂、東部役寮室、三寶殿、鐘鼓樓、茶處、寶物館、倉庫、西部役寮室、東司、一文字廊下、觀音大銅像等；境內又有羯林、三松關、千光城、吹上墀等十境，寺院和神社相關的建築物林立其中，是關東著名巨剎。

總持寺建築巡禮
如前所述，現在的總持寺大多是二十世紀後新建的建築，但也可見一些從別處搬遷過來的歷史悠久建築；其中，大祖堂（1965年竣工）、三門（1969年竣工）是太平洋戰爭之後建造的鋼筋混凝土建築，佛殿（1915年竣工）等主要建物則是二十世紀前半期的木造建築。2005年，總持寺的三松關（總門）、向唐門、香積台、大僧堂、百間廊下和門、佛殿、待鳳館、紫雲台、御靈殿、虎嘯窟、放光堂、鐘鼓樓、衆寮、放光觀音台座、鐘樓、三寶殿等十六棵建築登錄有形文化財。

如此新舊混合的結果，於是出現大祖堂（高約十層樓，堂內供奉高祖道元、太祖瑩山、二祖峨山等歷代祖師）的規模比佛殿（供奉釋迦牟尼佛）還大的情況也就不奇怪了，或可說也是總持寺的特色之一。

位於三門北側的三松閣於1986年竣工，這座高四層樓的修行道場占地9400平方米，規模也十分宏大。作為禪宗的主要國際道場之一，總持寺位於通往日本海的大門——橫濱，是一個開放的修行中心，由於地處便利，也有利於為公司職員、坐禪小組及其他社會、社區的需要舉辦各種課程。

寺內有一條著名的「百間廊下」，這條長164公尺的廊道連通東、西伽藍，又將內苑與外苑分割兩端；穿過廊道，佛殿便出現在眼前。佛殿又名大雄寶殿，是七堂伽藍的中心，殿內供奉本尊釋迦牟尼如來像。

寺院南部有一座小山丘，山上除了有梵鐘樓、三寶殿外，還豎立着一尊平成救世觀音像。

總持寺裡還有一尊日本最大、木製的大黑天神，供奉在香積台（類似遊客服務中心），有許多參訪者前來膜拜。大黑天神是日本七福神之一，掌管飲食及農作，祂一手持小槌、一手背著米袋，是帶給人們富足與平安的福神。

「無際大師」肉身之謎
總持寺的珍貴文化財中，最特別的應該就是「無際大師」的肉身——1975年日本宣稱，在日本發現了中國唐代禪師石頭希遷的肉身，歷經千餘年至今保存完好，被學術界視為「世界唯一奇蹟」，如今供奉於總持寺。

石頭希遷禪師（700~790），人稱石頭和尚、石頭大師，諡號無際大師，法嗣江西青原行思禪師，是石頭宗的開創者。唐貞元六年 （公元790年，也就是禪師捨報那年），當時已91歲高齡的他自知來日無多，悄然回到湖南南台寺，不再進食，但囑門徒將他平時收集來的百多種草藥熬成湯，每日飲十多碗。一個月後，人清瘦了，但臉色紅赤，雙目如炬。

有一天，禪師口念佛經，端坐不動，安詳地圓寂了。過了一個多月，禪師的肉身不但沒有腐爛，反而芳香四溢，眾人皆震驚，認為這是禪師修行深、功德無量的展現，特地建了寺廟敬奉。

那麼，石頭希遷禪師的肉身為什麼會在日本？1975年左右，《香港快報》曾刊載一則消息：「無際大師肉身供奉東瀛」。該文記述，1930年代，大陸軍閥割據、戰亂頻繁，當時潛伏在湖南南嶽一帶、以牙科醫生身分為掩護的日本間諜渡邊四郎，某日乘亂毒死寺廟的小和尚、偷走了無際禪師的肉身，之後他偷偷將禪師的肉身運到日本，私自珍藏、秘而不宣。

1947年渡邊身亡，人們清理遺物時在他的日記裡得知這個重大秘密。當人們打開渡邊的秘密倉庫，只見禪師肉身完好、盤腿而坐、狀如活人。當時有關方面也立即託人到中國湖南南嶽附近尋找禪師之墓，也終於找到了，但墓裡是空的。

之後經過調查，證實「石頭和尚肉身」是1911年辛亥革命前後從福建漳州經上海運抵日本的。為了弄清真相，中國佛教協會1995年特派專人到漳州實地調查，發現「漳州無際大師肉身」很可能是唐宋時當地一位以「無際」為法名的和尚的真身，而「南嶽石頭希遷無際大師肉身」在抗戰時期被盜一說，查無實據。而日本曹洞宗僧人出於對石頭希遷大師的尊崇，將此肉身安置於總持寺中虔誠供奉 。

無論如今供奉在總持寺的是漳州無際大師的肉身，還是南嶽石頭希遷無際大師肉身？這則頗具傳奇色彩的新聞引起了許多人注目，日本醫學界更從醫學角度研究肉身為何能保存千餘年而不壞？並出版了《無際大師肉身》一書。